Lembaga Kemahasiswaan dan Alumni adalah unit kerja dibawah Wakil Rektor Bidang Kemahasiswaan, Kerjasama dan Alumni yang memiliki tugas pokok dan fungsi pada tatanan implementasi keijakan-kebijakan yang terkait dengan 1) pembinaan kemahasiswaan yang mencakup, pembinaan bidang minat dan bakat, bidang penalaran yang berkaitan dengan program studi dan pengembangan wawasana dan keilmuan mahasiswa dalam bidang pendidikan, sains, teknologi dan kesehatan serta melakukan pertukaran mahasiswa dalam bentuk magang baik nasional dan internasional, dan 2) Mengembangkan jejaring Alumni Universitas PGRI Yogyakarta dimanapun berada melalui kegiatan yang bersifat membangun.

Lembaga Kemahasiswaan, Kerjasama dan Alumni merupakan unit kerja dibawah instruksi kerja Wakil Rektor Bidang Kemahasiswaan, Kerjasama dan Alumni yang bertanggung jawab terkait

1. Menyusun program kegiatan pada bidang Kemahasiswaan, Kerjasama dan Alumni
2. Mengkoordinasikan pelaksanaan kegiatan di Lembaga Kemahasiswaan dan Alumni pada bidang/unit/lembaga terkait
3. Mengawasi, mengendalikan, dan mengevaluasi penyelenggaraan program dan kegiatan di bidang kemahasiswaan dan alumni.
4. Mengelola keseluruhan kegiatan kemahasiswaan dan alumni Universitas PGRI Yogyakarta
5. Melaksanakan dan melaporkan kegiatan tracer study Universitas PGRi Yogyakarta.
6. Membantu kelancaran penyelenggaraan akademik khususnya dalam pelaksanaan kegiatan kemahasiswaan dan alumni
7. Melaporkan kegiatan pada bidang kerja kemahasiswaan, dan alumni sebagai pertanggungjawaban.

Dalam menyusun program kerja Lembaga Kemahasiswaan dan Alumni memfokuskan pada pembinaan, pengembangan, pembimbingan, prestasi dan reputasi. Maka dari itu Lembaga Kemahasiswaan dan Alumni bersinergi dengan Organisasi Mahasiswa (ORMAWA) baik dibawah naungan universitas maupun di bawah pengelolaan program studi untuk menciptakan prestasi mahasiswa di bidang olah raga, kesenian dan budaya, kesehatan dan teknologi serta prestasi dibidang agama dan bersinergi dengan Keluarga Alumni Universitas PGRI Yggyakarta.